Banca de QUALIFICAÇÃO: PEDRO HENRIQUE SOUSA FERRO

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : PEDRO HENRIQUE SOUSA FERRO
DATA : 03/12/2021
HORA: 10:00
LOCAL: Web Conferência - Google Meet - meet.google.com/xzj-fecs-daj.
TÍTULO:

Determinação do tempo de viabilidade material genômico ambiental (eDNA) para detecção via PCR de fauna acompanhante em tanques de cultivo.

PALAVRAS-CHAVES:

aquicultura, primer, espécies invasoras, metabarcoding.

PÁGINAS: 45
RESUMO:

Um dos desafios na produção de pescado é a presença de fauna acompanhante, que pode se desenvolver junto com a espécie alvo ao longo do ciclo de cultivo, aumentando a biomassa dos viveiros, a disseminação de patógenos, reduzindo a qualidade de água e o ganho de peso da espécie-alvo. O DNA ambiental é uma mistura complexa de DNA genômico oriundo de organismos inteiros ou partes deles, presentes em amostras ambientais. O uso de DNA ambiental para avaliar distribuições de comunidades aquáticas é promissor, mas os esquemas de amostragem e análises precisam ser adaptados de acordo com objetivos específicos. Para que esta técnica possa auxiliar os produtores de organismos aquáticos e seja viável em escala comercial é necessária a avaliação da especificidade dos primers, para que se maximize a eficácia e minimize os riscos de falsos diagnósticos, e a determinação do tempo de viabilidade do material genômico ambiental na água. Foi avaliada a sensibilidade de um primer comercial e o tempo de viabilidade de DNA ambiental de peixes em ambiente lêntico (tanques de cultivo). Para a análise da sensibilidade e tempo de viabilidade foi utilizada água de três tanques de cultivo de 300 L com número conhecido de indivíduos de Oreochromis niloticus. A água dos tanques de cultivo foi transferida para outros três tanques de polietileno de 60 L, previamente limpos e tratados com agentes desnaturantes de ácidos nucleicos. Para análise do DNA vestigial foi coletada uma amostra de água de cada tanque aproximadamente 10 cm abaixo da superfície e em três etapas: coleta no dia da transferência da água (T0), 15 dias após a transferência (T15) e 30 dias após a transferência (T30). As amostras de água foram concentradas e o DNA foi extraído pelo kit PureLink™. As bibliotecas foram quantificadas por qPCR e sequenciadas no sequenciador Miseq (Illumina). Os resultados foram confrontados com o banco de dados de genoma mitocondrial de peixes MitoFish. Foi possível identificar sequências de DNA em duas amostras da coleta T0 que correspondiam à espécie Oreochromis niloticus, uma com 114861 e outra com 2019 sequências. Em uma amostra foi identificada apenas uma sequência de DNA, não sendo possível identificar a espécie. As amostras das coletas T15 e T30 estão em processamento laboratorial. A amplificação por PCR positiva do DNA ambiental presente nas amostras de água confirmou a eficiência do primer e desta metodologia altamente reprodutível, rápida e tecnicamente fácil. Traços de Oreochromis niloticus puderam ser detectados a partir do DNA ambiental, permitindo que no uso a campo se tenha respostas de gestão e rastreamento de espécies invasoras presentes no reservatório.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 2613308 - DELANO DIAS SCHLEDER
Interna - 1046884 - ELIZABETH SCHWEGLER
Interno - 2017813 - RICARDO EVANDRO MENDES
Interna - 2408296 - SORAYA REGINA SACCO